Licenciatura en Biotecnología

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Examinando Licenciatura en Biotecnología por Materia "Diagnosis"

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    Detección molecular de coronavirus endémicos y enterovirus D68 en muestras respiratorias del año 2016 en Panamá
    (Universidad Latina de Panamá, 2025) Quintero Whittaker, Yobelis Stacy; Castillo Mewa, Juan A. [asesor]
    Los Coronavirus humanos (CoVh) 229E, HKU1, NL63 y OC43 son endémicos a nivel mundial y aunque normalmente se asocian con enfermedades respiratorias leves, también pueden causar infecciones graves en bebés, ancianos y personas inmunocomprometidas. Por otro lado, desde el descubrimiento de Enterovirus D-68 (EV-D68) sólo se habían reportado casos esporádicos, sin embargo, en 2014 ganó importancia luego de un brote ocurrido en Estados Unidos y un aumento simultáneo de los casos de mielitis flácida aguda. Este virus puede causar infecciones leves y graves, afectando principalmente a niños menores de 5 años. En Panamá durante el año 2016, el Programa de vigilancia para Influenza y otros virus respiratorios recibió 4,041 muestras de personas con síntomas de infecciones respiratorias, de las cuales un 68.78% (n=2,537/4,041) fue positivo para uno o más de los 12 virus incluidos dentro del panel viral respiratorio (Influenza A/H1 pandémico, Influenza A/H3, Influenza A/No tipificable, Influenza B/VIC, Influenza B/YAM, Virus Sincitial Respiratorio, Metapneumovirus humano, Parainfluenza tipo 1, Parainfluenza tipo 2, Parainfluenza tipo 3, Adenovirus y Rhinovirus). Debido a la necesidad de conocer cuáles otros virus pudieron causar estas infecciones respiratorias, nos propusimos a realizar una búsqueda retrospectiva de Coronavirus endémicos y EV-D68 en las muestras recibidas durante el año 2016, con el objetivo principal de detectar a alguno de estos virus menos frecuentes en las muestras negativas de ese año. Se hizo una selección de 127 muestras de hisopados nasofaríngeos, de las cuales el 70% eran negativas (n=89) a los virus del panel viral respiratorio. Las muestras positivas (n=38) se utilizaron para evaluar coinfecciones con otros virus respiratorios detectados en el panel viral. Las muestras se clasificaron según grupo etario (<5 años, 5-18 años y >18 años), según tipo de atención médica y según región del país de procedencia. Se extrajeron los ácidos nucleicos utilizando un equipo automatizado (Thermo Scientific Kingfisher Flex) y el extraído se amplificó mediante una RT-PCR en tiempo real de un sólo paso. CoVh-229E, CoVh-NL63 y CoVh-OC43 se detectaron mediante un ensayo multiplex, mientras que CoVh-HKU1 y EV-D68 se detectaron empleando reacciones de PCR individuales. El 18.11% de las muestras resultaron positivas (n=23/127). Estas se distribuyeron en un 2,36% (n=3/127) para CoVh-229E, 2,36% (n=3/127) para CoVh-OC43 y 13,39% (n=17/127) para EV-D68. Además, se observó que el 13,15% (n=5/38) de las muestras estaban coinfectadas. Se presentaron coinfecciones entre CoVh-229E con Influenza A/H1 pandémico, CoVh-OC43 con Parainfluenza tipo 1, EV-D68 con Rhinovirus, EV-D68 con el Virus Sincitial Respiratorio y EV-D68 con Parainfluenza tipo 3. El 78.26% (n=18/127) de las muestras positivas provenían de sujetos hospitalizados y el 21.74% (n=5/127). de sujetos ambulatorios. En cuanto a la edad, el 52.17% (n=12/127) correspondían a niños <5 años, el 13.04% (n=3/127) a sujetos entre 5-18 años y el 34.8% (n=8/127) a adultos >18 años. Por otro lado, no se detectaron casos de CoVh-NL63 ni CoVh-HKU1. Estos resultados resaltan la importancia de detectar las infecciones causadas por estos virus respiratorios, que permitan aportar conocimiento sobre la epidemiología de estos virus menos frecuentes en nuestro país.